Что такое вгп труба: Что такое труба ВГП? Применение и базовые характеристики.

Содержание

Труба стальная водогазопроводная (ВГП) | АЗМТ

Описание

Основной деятельностью нашей компании является производство профильных, стальных и круглых труб на электросварочном стане из штрипса собственного изготовлении. В качестве сырья для нашей продукции используется рулонная сталь, прошедшая заводской контроль качества и полностью соответствующая требованиям ГОСТ. Качество используемого сырья подтверждено соответствующими сертификатами от производителей.

Производство труб водогазопроводных

Сырьем для трубы ВГП служит листовой прокат из углеродистой стали марок Ст1-2кп, Ст1-1-2пс, Ст1-08пс. Марка отличается низкой ценой, высоким уровнем свариваемости, устойчивостью к напору жидкостей широкого диапазона температур.

Существуют два типа конструкции стальных водогазопроводных труб:

С прямым швом. Листовую сталь сгибают, образуя круглое сечение, сварной шов идет параллельно оси трубы.
Со спиральным швом. Стальную полосу (штрипса) методом навивки преобразуют в трубу, края полосы соединяют путем электродуговой сварки.

При изготовлении труб ВГП качество шва превышает качество самого изделия. Для защиты от коррозии и других вредных воздействий на трубу наносится цинковое покрытие.

Пределы размеров труб ВГП

диаметр (внутренний и внешний) — 4-150 мм;
толщина стенки

— легкая — 1,8-4 мм;

— обыкновенная — 2-4,5 мм;

— усиленная — 2,5-5,5 мм.

вес — 0,37—21,63 кг/п.м.;

длина — 4-12 м.

Толщина стенок трубы зависит от условий применения:

для систем горячего водоснабжения используются трубы ВГП с толстыми стенками;
для систем холодного водоснабжения — со стенками средней толщины;
для бытовых газопроводов нужны трубы с тонкими стенками.

При сохранении общей массы изделия, допускаются небольшие отклонения от установленных стандартов по толщине стенок.

Наименование	Вид	Размер	Марка стали	ГОСТ
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	6х1,8	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	6х2,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	6х2,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	8х2,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	8х2,2	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	8х2,8	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	10х2,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	10х2,2	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	10х2,8	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	15х2,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	15х2,8	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	15х3,2	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	20х2,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	20х2,8	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	20х3,2	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	25х2,8	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	25х3,2	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	25х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	32х2,8	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	32х3,2	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	32х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	40х3,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	40х3,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	40х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	50х3,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	50х3,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	50х4,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	65х3,2	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	65х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	65х4,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	80х3,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	80х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	80х4,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	90х3,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	90х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	90х4,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	100х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	100х4,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	100х5,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	125х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	125х4,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	125х5,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	150х4,0	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	150х4,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262
Труба стальная	водогазопроводная (ВГП)	150х5,5	3,10,20/09г2с	ГОСТ 3262

Труба ВГП цена в Иркутске

Труба ВГП оцинкованная с резьбой
Труба ВГП с резьбой
Труба ВГП ГОСТ 3262-75

Продукция:	Ед. измерения:	Кол-во:	Цена, от:	Наличие:	Купить
Труба ВГП 32х3,2 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 50х3,5 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 20х2,8 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 25х2,8 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 25х3,2 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 40х3 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 10х2,2 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 32х2,8 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 65х4 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 80х4 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 40х3,5 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии
Труба ВГП 15х2,8 ГОСТ 3262-75			43500 ₽ 4350043500 ₽	В наличии

Труба ВГП

Труба ВГП (водогазопроводная) является разновидностью трубного стального проката, предназначенного для монтажа трубопроводов различного назначения. Сюда относятся бытовые газопроводы, системы водоснабжения, отопительные системы.

Технология изготовления предусматривает формовку и сварку металлических полос из листовой конструкционной стали. Особое внимание уделяется выполнению и качеству сварного шва, который должен обеспечивать прочность, устойчивость, полную непроницаемость изделия.

Труба ВГП оцинкованная является наиболее популярной разновидностью данной продукции. Преимуществами трубы с покрытием из цинка являются высокая прочность и износостойкость. Купить оцинкованные трубы следует для монтажа внутренней разводки системы подачи воды, устройства водопроводных сетей.

Соблюдение инструкций и технологии изготовления позволяет исключить наличие дефектов на готовой продукции. На поверхности изделия должны отсутствовать расслоения, вмятины, трещины, неровности. Обязательным этапом производства является обрезка концов, которые режутся строго под прямым углом.

Труба ВГП ГОСТ 3262-75 (ГОСТ 10704-91 для оцинкованных труб) изготавливается из стали 08ПС, Ст1-2КП. Особенности и характеристики материала обеспечивают хороший уровень свариваемости, высокую прочность, надежность.

Трубы ВГП способны выдерживать большое давление газа или воды. С их помощью производится транспортировка жидких и газообразных субстанций различной температуры.

Идеально гладкая поверхность изделия может иметь небольшое утолщение с незначительным сужением диаметра в области шва. Цена изделия зависит от классификации продукции. Трубы бывают обычными, облегченными, утяжеленными. Толщина стенок определяет принадлежность изделия к определенному виду — по этому параметру трубы могут относиться к толстостенным, тонкостенным или стандартным. Диаметр среза трубы и толщина стенки влияют на прочность трубы, а также на способность выдерживать определенное давление. Для соединения элементов используются два способа — сварка и использование резьбовых соединений. Резьба, нанесенная для удобства эксплуатации, бывает двух типов — длинной или под накатку.

Компания в цифрах

75 гектаров
производственных и складских
1500 тонн
металлопроката всегда в наличии
10 лет
безупречной работы
10000
довольных клиентов
324 единицы
техники в автопарке
1000
сотрудников и высококлассных специалистов
83 города
с филиалами нашей компании

Почему стоит выбирать именно нас

Персональный менеджер закрепляется за каждым клиентом
Возможность согласовать постоплату и рассрочку
Доставка точно в срок
Высокое качество продукции, подтверждённое сертификатами

Широкий ассортимент более 200 000 позиций
Низкие цены за счёт собственного производства
Предоставляем услуги по всем видам обработки металла

Остались вопросы?

Задайте их прямо сейчас.

Наш менеджер свяжется с Вами в ближайшее время и проконсультирует Вас.

Поля, обязательные для заполнения.
Отправляя заявку, вы соглашаетесь на обработку персональных данных.

Заявка на расчёт

Условия политика конфиденциальности

Ваш город
Иркутский филиал ПКФ «Айсберг АС»?

ПодтвердитьВыбрать другой

Заявка на поставку
металлопроката

*Поля, обязательные для заполнения

Отправляя заявку, вы соглашаетесьна обработку
персональных данных.

Пензенская область

Пензенский филиал ПКФ «Айсберг АС»

Напишите нам

*Поля, обязательные для заполнения

Отправляя заявку, вы соглашаетесьна обработку
персональных данных.

Арматура 6 A500C ГОСТ 5781-82

Найдено в товарах

36000 36000 ₽

Арматура 6 A500C ГОСТ 5781-82

м.

37000 ₽ 3500036000 ₽В наличии

Арматура 6 A500C ГОСТ 5781-82

Найдено в товарах

36000 36000 ₽

Сборочный конвейер ВГП

— короткая версия

The Vertebrate Genome Project (VGP), проект консорциума Genome 10K (G10K), направлен на создание высококачественных, почти безошибочных, без пробелов, аннотированных эталонных геномных сборок на уровне хромосом, с разбивкой по фазам гаплотипов для каждого виды позвоночных (Rhie et al. 2020). VGP разработала полностью автоматизированный конвейер сборки генома de-novo , в котором используется комбинация трех различных технологий: высокоточное считывание Pacbio (HiFi), оптические карты Bionano и захват конформации хроматина «все против всех» (Hi-C). ) данные.

В результате сотрудничества с командой VGP для обучающей сети Galaxy было разработано обучение, включающее пошаговое подробное описание выбора параметров для каждого этапа сборки (Lariviere и др. 2022). Вместо этого в следующем учебном пособии представлен краткий обзор того, как можно использовать рабочие процессы для быстрой сборки генома с использованием конвейера VGP с системой рабочих процессов Galaxy (GWS).

GWS обеспечивает повторяемость анализа, сводя к минимуму количество ручных операций, необходимых для выполнения рабочего процесса анализа, и автоматизируя процесс ввода параметров и отслеживания версий программных средств. Цель этого обучения — объяснить, как запустить рабочий процесс VGP, сосредоточив внимание на том, какие входные данные требуются и какие выходные данные генерируются, и делегируя выполнение шагов GWS.

Повестка дня
В этом уроке мы рассмотрим:
Введение
Начало работы с Galaxy
Структура рабочего процесса сборки VGP
Получить данные
Импорт рабочих процессов из WorkflowHub
Анализ профиля генома
Сборка с hifiasm
Очистка с помощью purge_dups
Гибридные леса с оптическими картами Bionano
Леса Hi-C
Заключение

В этом учебном пособии предполагается, что вы умеете получать данные в Galaxy, выполнять задания, управлять историей и т. д. Если вы не знакомы с Galaxy, мы рекомендуем вам посетить учебную сеть Galaxy. Попробуйте начать со следующих тренингов:

Знакомство с Galaxy
Галактика 101
Получение данных в Galaxy
Использование коллекций наборов данных
Введение в Galaxy Analyses
Понимание системы истории галактики
Загрузка и удаление данных в Galaxy

Конвейер сборки VGP имеет модульную организацию, состоящую из пяти основных подпроцессов (рис. 1), каждый из которых объединен рядом этапов обработки данных. Во-первых, он позволяет оценивать промежуточные этапы, что облегчает изменение параметров при необходимости без необходимости начинать с начального этапа. Во-вторых, это позволяет адаптировать рабочий процесс к имеющимся данным.

Рисунок 1 : Конвейер сборки ВГП. Рабочий процесс VGP реализован по модульному принципу: он состоит из пяти независимых подпроцессов. Кроме того, он включает некоторые дополнительные рабочие процессы (не показаны на рисунке), необходимые для экспорта результатов в GenomeArk.

Конвейер VGP сначала использует программу сборки для создания непрерывных последовательностей в сборке (контигов). Когда данные Hi-C и данные Bionano доступны, они используются для создания одного или нескольких контигов, соединенных последовательностью пробелов (скаффолдов). Когда доступны оба типа данных, сначала запускается каркас Bionano, а затем каркас Hi-C, но если оптические карты недоступны, то на контигах можно запустить каркас HiC.

Получить данные

Первым шагом для этого руководства является получение наборов данных от Zenodo. Конвейер сборки VGP использует данные, сгенерированные различными технологиями, включая чтение PacBio HiFi, оптические карты Bionano и карты взаимодействия хроматина Hi-C.

Вы можете найти данные VGP по следующему пути: /species/${Genus}_${species}/${specimen_code}/genomic_data . Внутри заданного каталога типа данных (, например, pacbio ) выберите все соответствующие файлы по отдельности, пока все нужные файлы не будут выделены, и нажмите кнопку Ok . Обратите внимание, что в списке может быть несколько страниц файлов. Также обратите внимание, что вам может понадобиться не каждый файл в списке.

WorkflowHub — это система управления рабочими процессами, которая обеспечивает СПРАВЕДЛИВОСТЬ (находимость, доступность, совместимость и повторное использование) рабочих процессов, возможность цитирования, управление профилями метаданных и открытый доступ для просмотра и аналитики.

Рисунок 2 : Главное меню рабочего процесса. В меню рабочего процесса перечислены все импортированные рабочие процессы. Он предоставляет полезную информацию для организации рабочих процессов, например, последнее обновление и теги. Рабочие процессы можно запустить, щелкнув значок воспроизведения, отмеченный красным на изображении.
После того, как мы импортировали наборы данных и рабочие процессы, мы можем начать сборку генома.

Теперь, когда наши данные и рабочие процессы импортированы, мы можем запустить наш первый рабочий процесс. Перед запуском сборки нам необходимо собрать показатели свойств рассматриваемого генома, например ожидаемый размер генома согласно нашим данным. Настоящий конвейер использует Meryl для создания базы данных k-mer и Genomescope2 для определения характеристик генома на основе анализа k-mer.
После завершения рабочего процесса мы можем оценить линейный график, сгенерированный геномоскопом (рис. 3), который включает ценную информацию, такую как наблюдаемый профиль k-mer, подогнанные модели и оценочные параметры. Этот файл соответствует набору данных 26 .
Рисунок 3 : Профиль k-mer GenomeScope2. Первый пик, расположенный примерно в 25 раз, соответствует гетерозиготному пику. Второй пик при 50-кратном увеличении соответствует гомозиготному пику. График также включает информацию о предполагаемой общей длине генома (len), проценте уникальной длины генома (uniq), общем уровне гетерозиготности (ab), среднем покрытии k-mer для гетерозиготных оснований (kcov), частоте ошибок чтения (err), средняя частота дупликаций чтения (dup) и размер k-mer (k).
Это распределение является результатом процесса Пуассона, лежащего в основе генерации считываний секвенирования. Как мы видим, профиль k-mer следует бимодальному распределению, указывающему на диплоидный геном. Распределение согласуется с теоретической диплоидной моделью (подгонка модели > 93%). Низкочастотные k -меры являются результатом ошибок секвенирования и обозначены красной линией. GenomeScope2 оценил размер гаплоидного генома примерно в 11,7 Мб, что достаточно близко к размеру генома Saccharomyces .

Для создания контигов конвейер VGP использует hifiasm . Следующим шагом после профилирования генома является запуск поэтапной сборки VGP HiFi с рабочим процессом данных hifiasm и HiC 9.0069 . Этот рабочий процесс использует hifiasm (режим HiC) для создания гаплотипов с фазой HiC (hap1 и hap2). Это отличается от его режима по умолчанию, который генерирует первичные и альтернативные сборки псевдогаплотипов. Этот рабочий процесс включает в себя три инструмента для оценки качества сборки: gfastats , BUSCO и Merqury .
В рабочем процессе : поэтапная сборка VGP HiFi с hifiasm и меню данных HiC :

Судя по отчету, обе сборки довольно похожи; первичная сборка включает 18 контигов , совокупная длина которых составляет около 12,2 Мбит/с. Альтернативная сборка включает 17 контигов, общая длина которых составляет 11,3 Мб. Как мы видим на рисунке 4a, обе сборки близки к предполагаемому размеру генома, что, как и ожидалось, поскольку мы использовали режим hifiasm-HiC для создания поэтапных сборок, что снижает вероятность ложных дупликаций, которые могут увеличить размер сборки.
Далее мы собираемся оценить выходные данные, созданные BUSCO . Этот инструмент обеспечивает количественную оценку полноты сборки генома с точки зрения ожидаемого содержания генов. Он основан на анализе генов, которые должны присутствовать только один раз в полной сборке или наборе генов, допуская при этом редкие дупликации или потери генов (Simão 9).0003 и др. 2015).
Рисунок 4 : Полная таблица BUSCO. Он содержит полные результаты в табличном формате с очками и продолжительностью матчей BUSCO, а также координатами.
Как мы видим в отчете, результаты упрощены в четыре категории: полные и единичные копии , полные и дублированные , фрагментированные и отсутствующие .

Несмотря на то, что BUSCO является надежным для видов, которые были широко изучены, он может быть неточным, когда вновь собранный геном принадлежит к таксономической группе, которая плохо представлена в OrthoDB. Merqury предлагает дополнительный подход к оценке показателей качества сборки генома без эталонного способа с помощью k -анализ количества копий mer. В частности, он использует наш hap1 в качестве первой сборки генома, hap2 в качестве второй сборки генома и базу данных merylDB, сгенерированную ранее для подсчета k-меров. Как и другие показатели контроля качества, которые мы рассматривали, рабочий процесс VGP Hifiasm-HiC автоматически генерирует анализ Merqury.
По умолчанию Merqury генерирует три набора выходных данных: статистика, графики и статистика согласованного качества сборки (QV). Коллекция «stats» содержит статистику полноты, а коллекция «QV stats» содержит статистику значения качества. Давайте посмотрим на график спектра числа копий (CN), известный как 9Спектры 0005-cn участок. График спектра-cn показывает обе ваши сборки (здесь ваши гаплотипы), взятые вместе и (рис. 6а). Здесь мы видим небольшое количество ложных дупликаций: на отметке 50 по оси x имеется небольшое количество k-меров, присутствующих в 3-копии в двух сборках (зеленая выпуклость).
Рисунок 5 : График Merqury CN для этих гаплотипов дрожжей. График отслеживает множественность каждого k-мера, найденного в наборе для чтения, и окрашивает его в соответствии с тем, сколько раз он встречается в данной сборке. Merqury соединяет среднюю точку каждой ячейки гистограммы линией, создавая иллюзию плавной кривой. K-мерное распределение обоих гаплотипов (а). K-мерное распределение индивидуального гаплотипа (б)
Таким образом, мы знаем, что в одной из наших сборок имеется некоторая ложная копия (3-копийная зеленая выпуклость) как 2-копия, но мы не знаем, какая именно. Мы можем посмотреть на индивидуальный спектр количества копий для каждого гаплотипа, чтобы выяснить, какой из них содержит 2-копийные k-меры (, т. е. , ложные дупликации). На графике спектров Merqury-CN для hap2 мы можем видеть небольшую выпуклость 2-копийных k-меров около отметки 50 по оси x (рис. 6b).
Теперь, когда мы знаем, какой гаплотип содержит ложные дупликации, мы можем запустить рабочий процесс очистки, чтобы попытаться избавиться от этих дупликаций.

Идеальное гаплоидное представление будет состоять из одной аллельной копии всех гетерозиготных областей в двух гаплотипах, а также всех гемизиготных областей в обоих гаплотипах (Guan et al. 2019). Однако в сильно гетерозиготных геномах алгоритмы сборки часто не в состоянии идентифицировать сильно расходящиеся аллельные последовательности как принадлежащие к одной и той же области, что приводит к сборке этих областей в виде отдельных контигов. Чтобы предотвратить потенциальные проблемы в последующем анализе, мы собираемся запустить Сборка очистки VGP с рабочим процессом purge_dups , который позволит идентифицировать и переназначать гетерозиготные контиги. Этот шаг необходим только в том случае, если наблюдаются гаплотипические дупликации, а результат следует тщательно проверить на наличие чрезмерной очистки.
В рабочем процессе : сборка очистки VGP с меню конвейера purge_dups :

После очистки сборок, созданных hifiasm , следующим шагом будет запуск гибридного каркаса VGP с рабочим процессом оптических карт Bionano. Он будет интегрировать информацию, предоставленную оптическими картами, с последовательностями первичной сборки, чтобы обнаруживать и исправлять химерные соединения и неправильно ориентированные контиги. Кроме того, этот рабочий процесс включает в себя несколько дополнительных шагов для оценки выходных данных.
В рабочем процессе : гибридные леса VGP с оптическими картами Bionano меню:

param-file « Hifiasm Purgeed Assembly »: 90: Purge перекрывает данные 88 и данные 33: очищенные последовательности get_seqs (примечание: номера данных могут отличаться в вашем рабочем процессе, но они все равно должны быть помечены p1 из рабочего процесса purge_dups)
Как мы видим на кумулятивном графике файла 119 (рис. 7а), общая длина сборки (12 160 926 пн) несколько превышает ожидаемый размер генома. По статистике NG50 (рис. 7б) значение составляет 922,430 п.н., что значительно превышает значение, полученное на первом этапе оценки (813,039 п.н.).бп). Это увеличение NG50 означает, что эта сборка с каркасом более непрерывна по сравнению с контигами без каркаса.
Также рекомендуется проверить выходов BUSCO . На сводном изображении (рис. 7с), которое можно найти в наборе 117 , мы можем оценить, что большинство универсальных однокопийных ортологов присутствуют в нашей сборке в ожидаемой единственной копии.
На этом заключительном этапе мы запустим гибридный каркас VGP с данными HiC , который использует тот факт, что частота контактов между парой локусов сильно коррелирует с одномерным расстоянием между ними. Эта информация позволяет в дальнейшем возводить леса Bionano с использованием SALSA2 , обычно образующие каркасы на уровне хромосом.
В рабочем процессе : Гибридные леса VGP с данными HiC :

Рисунок 6 : Карты Hi-C, созданные Pretext с использованием данных Hi-C. Красные кружки указывают на различия между контактными картами, созданными после (а) и до (б) гибридных каркасов Hi-C.
Области, отмеченные красными кружками, выделяют наиболее заметное различие между двумя контактными картами, где инверсия была исправлена.
Подводя итог, стоит сравнить окончательную сборку с эталонным геномом S. cerevisiae S288C.
Рисунок 7 : Сравнение окончательной сборки, созданной в ходе этого обучения, и эталонного генома. График смежности с использованием эталонного размера генома (а). Статистика сборки (б).
Относительно общей длины последовательности можно сделать вывод, что размер сборки нашего генома практически идентичен эталонному геному (рис.9).а, б). Примечательно, что эталонный геном состоит из 17 последовательностей, в то время как наша сборка включает всего 16 хромосом. Это связано с тем, что эталонный геном также включает последовательность митохондриальной ДНК, которая состоит из 85 779 п.н. Остальные статистические данные имеют очень близкие значения (рис. 9b).
Рисунок 8 : Сравнение карт контактов, созданных с использованием окончательной сборки (а) и эталонного генома (б).
Если мы сравним карту контактов нашего собранного генома (рис. 10а) с эталонной сборкой (рис. 10б), мы увидим, что они неразличимы, что позволяет предположить, что мы создали сборку генома на уровне хромосом.
Трубодвигатель Vestil с V-образными канавками 1000 фунтов Пенопластовые колеса 17 x 30 VGP-100-FF